Výzkumný tým 14: Genetika a šlechtitelské metody

Pracovní pozice a specializace: vedoucí vědecký pracovník – rezistence k chorobám (fuzariózy klasu, BYDV)

Cílem činnosti týmu je přispět svými poznatky ke zvýšení rezistence a adaptability obilovin. Výzkum zahrnuje studium geneticky podmíněné rezistence obilnin k významným chorobám na základě provokačních testů v polních i v regulovaných podmínkách i na základě využití dostupných molekulárních markérů. Jsou vyhledávány nové zdroje rezistence a vytvářeny materiály se zvýšenou úrovní rezistence využitelné dále ve šlechtění. Současně je monitorován výskyt původců chorob obilovin, jsou analyzovány patotypy a sledovány populační změny. Je studován genetický základ adaptačních schopností pšenice. Jsou rozvíjeny a aplikovány molekulární metody využitelné ve šlechtění na rezistenci a adaptabilitu obilovin.

Výzkum

• genetika rezistence ke rzem, detekce zdrojů rezistence, studium rasových a populačních změn původců (Puccinia triticina, P. graminis, P. striiformis, P. coronata)
• rezistence k listovým skvrnitostem pšenice – detekce zdrojů, monitoring výskytu původců (Mycosphaerella graminicola, Phaeosphaeria nodorum, Pyrenophora tritici – repentis), inovace metod umělé infekce
• fuzariózy klasu – hodnocení rezistence odrůd a vyhledávání zdrojů rezistence, monitoring výskytu klasových fuzarióz a kontaminace zrna pšenice mykotoxiny na území ČR, ochranná opatření
• studium chorob vyskytujících se v závislosti na pěstebných systémech (sněti, choroby pat stébel, virózy) – výskyt, hodnocení rezistence a detekce zdrojů
• studium genetického základu adaptačních schopností pšenice (geny a alely růstu a vývoje a ranosti)
• rozvoj a aplikace molekulárních metod, které přispívají ke zvýšení účinnosti šlechtění na rezistenci a adaptabilitu obilovin

Další činnosti

• vedení sbírek biotrofních patogenů obilnin (rez pšeničná, rez travní, rez plevová, padlí travní) v rámci Národního programu genetických zdrojů mikroorganismů
• tvorba šlechtitelských polotovarů

Jiné činnosti (služby)

• hodnocení rezistence odrůd v rámci registračního procesu a při doporučování – spolupráce s ÚKZÚZ
• diagnostika houbových patogenů jako servis pro pěstitele plodin, poradenské firmy a státní správu
• příprava inokula pro šlechtitelské firmy
• zemědělské poradenství v oblasti rezistence k chorobám obilovin

Mgr. Alena Hanzalová, PhD.: samostatný vědecký pracovník – rezistence k chorobám (listové choroby obilovin, stéblolam)

RNDr. Veronika Dumalasová, PhD.: vědecký pracovník – rezistence ke snětím, aplikace molekulárních markérů pro detekci genů rezistence

Mgr. Taťána Sumíková, PhD.: vědecký pracovník – aplikace molekulárních markérů, studium diverzity patogenů na molekulární úrovni

Mgr. Jana Palicová, PhD.: vědecký pracovník – mykologie (studium populací patogenů, rasového spektra a patogenity izolátů)

Ing. Martina Trávníčková: samostatný odborný pracovník – geny a alely růstu, vývoje a ranosti, aplikace molekulárních markérů

Ing. Ondřej Zelba: vědecko-výzkumný pracovník – aplikace molekulárních markérů, studium diverzity patogenů na molekulární úrovni

Ing. Šárka Bártová: samostatný vědeckotechnický pracovník – zajištění pokusů s klasovými fuzariózami a BYDV, rozbory, zpracování výsledků, administrace projektů

Ing. Ingrid Rutrlová: samostatný technik – technické zajištění a zpracování výsledků polních, skleníkových a laboratorních pokusů

Lenka Urbánková: samostatný technik – umělé infekce, hodnocení rezistence ke rzím a snětím, rozbory, zajištění polních prací, zpracování výsledků

Kontakty na pracovníky týmu (telefon, mobil, e-mail) naleznete zde.

 

• MZE RO0417: Udržitelné systémy a technologie pěstování zemědělských plodin pro zlepšení a zkvalitnění produkce potravin, krmiv a surovin v podmínkách měnícího se klimatu
  Věcná etapa 14: Genetické základy šlechtění na rezistenci a adaptabilitu (produktivitu) obilovin (řešitel)
• Národní program konzervace mikroorganismů: vedení sbírky rzí a padlí travního (řešitel)
• Healthy minor cereals: An integrated approach to diversify the genetic base, improve stress resistance, agronomic management and nutritional/ processing quality of minor cereal crops for human nutrition in Europe (řešitel WP3)
• QK1710302 Zvýšení odolnosti pšenic vůči suchu, mrazu, padlí a fuzariózám klasu pomocí metod genomiky a proteomiky (podílí se na řešení)
• QJ1530373 Integrovaná ochrana obilnin proti patogenům, plevelům a škůdcům pro udržitelné produkce potravin, krmiv a surovin (podílí se na řešení)
• FV10213 Platforma pro identifikaci a interpretaci stresových faktorů v rostlinné produkci (podílí se na řešení)
• QJ1310055: Zvýšení ekonomické efektivity v zemědělské prvovýrobě využitím odrůd obilovin s vyšší odolností k mrazu, suchu a virózám, vhodných pro pěstitelské podmínky ČR v období silnějších výkyvů meteorologických vlivů (podílí se na řešení)
• LD14087: Odezva proteomu obilovin (ječmen, pšenice) na patogeny rodu Fusarium a jimi produkované mykotoxiny (podílí se na řešení)

 

Seznam vybraných publikací (2015 – 2017)

• Bartáková P., Palicová J., Slavíková L., Červená Z., Fousek J., Hanzalová A., Kumar J. (2016): Monitoring virových a houbových patogenů obilnin v jarním období. Rostlinolékař 6: 23-26.
• Beinhauer, J., Raus, M., Hanzalová, A., Horčička, P., Šebela, M. Intact spore MALDI-TOF mass spectrometry and proteomic analysis of Puccinia pathogenic fungi BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS , 2016, 1864 (9): 1093 – 1103
• Beoni, E., Chrpová, J., Jarošová, J., Kumar Kundu, J. Survey of Barley yellow dwarf virus incidence in winter cereal crops, and assessment of wheat and barley resistence to the virus. Crop & Pasture Science, 2016, 67 (10): 1054 – 1063
• Dumalasová, V., Bartoš, P. Reaction of wheat to common bunt and dwarf bunt and reaction of triticale to dwarf bunt. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 2016, 52 (3): 108 – 113
• Dumalasová, V., Palicová, J., Hanzalová, A., Bížová, I., Leišová-Svobodová, L.. Eyespot resistance gene Pch1 and methods of study of its effectiveness in wheat cultivars. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 2015, 51 (4): 166 – 173
• Faltusová, Z., Chrpová, J., Salačová, L., Džuman, Z., Pavel, J., Zachariášová, M., Hajšlová, J., Ovesná, J. Efect of Fusarium culmorum Tri Gene Transcription on Deoxynivalenol and D3G Levels in Two Different Barley Cultivars. Journal of Phytopathology, 2015, 163 (7-8): 593 – 603
• Hanzalová, A., Bartoš, P. Rez plevová na pšenici a ochrana proti ní. Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Praha, 2015, 34 pp.
• Hanzalová, A., Bartoš, P., Sumíková, T. Molekulární analýza genů rezistence ke rzi pšeničné. Úroda, 2015, 63(12): 18 – 20
• Hanzalová, A., Bartoš, P., Sumíková, T. Virulence of wheat leaf rust (Puccinia triticina Eriks.) in the years 2013–2015 and resistance of wheat cultivars in Slovakia. Cereal Research Communications, 2016, 44 (4): 585 – 593
• Hortová, B., Palicová, J., Strejčková, M., Nedělník, J. Optimalizace mulčování s ohledem na výskyt hub rodu Fusarium. Rostlinolékař, 2016, 27(4): 20 – 23
• Chrpová, J., Sumíková, T., Šíp, V., Váňová, M. Možnosti ochrany obilnin proti žluté zakrslosti ječmene. Úroda, 2016, 64(3): 34 – 38
• Chrpová, J., Horčička, P., Veškrna, O., Nežerka, A., Šíp, V. Zhodnocení přínosu fungicidního ošetření ozimé pšenice v roce 2015. Obilnářské listy, 2016, 24(1): 10 – 12
• Chrpová, J., Šíp, V., Sumíková, T., Salava, J., Palicová, J., Štočková, L., Džuman, Z., Hajšlová, J. Occurrence of Fusarium species and mycotoxins in wheat grain collected in the Czech Republic, World Mycotoxin Journal, 2016, 9 (2): 317 – 327
• Chrpová, J., Šíp, V., Štěrbová, L., Sumíková, T., Palicová, J. Metodika hodnocení rezistence pšenice ke klasovým fuzariózám v polních podmínkách. Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Praha, 2015, 16 pp.
• Ivaničová Z, Valárik M, Pánková K, Trávníčková M, Doležel J, et al. (2017) Heritable heading time variation in wheat lines with the same number of Ppd-B1 gene copies. PLOS ONE 12(8): e0183745. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0183745
• Mařík, P., Chrpová, J., Prášil, I., Sedláček, T. Six-row Winter Barley Lancelot. Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, 2015, 51 (2): 75 – 77
• Prášil, I., Chrpová, J., Hanzalová, A., Štěrbová, L., Musilová, J. Rezistence odrůd ozimé pšenice. Úroda, 2016, 64(7): 72 – 75
• Ryšánek, P., Grimová, L., Chrpová, J., Sumíková, T. Management obilných virů, přenosných Polymyxa graminis s důrazem na viry mozaikového komplexu ječmene. Česká zemědělská univerzita v Praze Praha, Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., 2016, 25 pp.
• Sumíková, T., Dumalasová, V., Trávníčková, M. Metodika použití molekulárních markerů k detekci genů rezistence ke rzem, padlí travnímu a stéblolamu a genů pro krátkostébelnost u pšenice. Praha, Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., 2016, 19 pp.
• Pasquali, M., Beyer, M., Logrieco, A., Audenaert, K., Balmas, V., Basler, R., Boutigny, A., Chrpová, J., Czembor, E., Gagkaeva, T., González-Jaén, M. T., Hofgaard, I. S., Köycü, N. D., Hoffmann, L., Lević, J., Marin, P., Miedaner, T., Migheli, Q., Moretti, A., Müller, M. E., Munaut, F., Parikka, P., Pallez-Barthel, M., Piec, J., Scauflaire, J., Scherm, B., Stanković, S., Thrane, U., Uhlig, S., Vanheule, A., Yli-Mattila, T., Vogelgsang, S. A European Database of Fusarium graminearum and F. culmorum Trichothecene Genotypes. Frontiers in Microbiology , 2016, 7: 11 pp.
• Rupert, J., Righetti, L., Stránská-Zachariášová, M., Džuman, Z., Chrpová, J., Dall´Asta, Ch., Hajšlová, J. Untargeted metabolomics based on ultra-high-performance liquid chromatography–high-resolution mass spectrometry merged with chemometrics: A new predictable tool for an early detection of mycotoxins. Food Chemistry, 2017, 224: 423-431
• Sumíková, T., Chrpová, J., Džuman, Z., Salava, J., Štěrbová, L., Palicová, H., Slavíková, P., Stránská-Zachariášová, M., Hajšlová, J. Mycotoxins content and its association with changing patterns of Fusarium pathogens in wheat in the Czech Republic. World Mycotoxin Journal, 2017, 10 (2): 143 – 151
• Šíp, V., Chrpová,J., Štěrbová, L., Palicová, J.: Combining ability analysis of fusarium head blight resistance in European winter wheat varieties. Cereal Research Communications, 2017, 45(2): 260-271
• Trávníčková, M., Pánková, K., Martinková, Z., Honěk, A. Length of prematurity period in wheat cultivars determines maximum cereal aphid abundance. Plant Protection Science, 2016, 52 (4): 254 – 261

______________________________________________